正确使用避孕套可使感染艾滋病的概率降低85％，感染淋病的概率则可降低85％.但却无法有效防止人类乳头状瘤病毒（简称HPV,克引起生殖器官附近皮肤和粘膜上的人类寻常疣、尖锐湿疣），阴部单纯疱疹（HSV）,梅毒和软下疳的传播，因为性病可通过避孕套无法覆盖的部位接触传播。

避孕套可能造成的健康损害

使用表面涂有添加剂的避孕套时，部分添加剂（如滑石粉）可能在性交中通过女性阴道进入其腹腔，并可能造成慢性损害。

在有些避孕套上使用的杀精剂Nonoxynol-9可能使避孕套的预防性病功能受到影响。

正确使用男用避孕套

1. 不要将避孕套置于贴身口袋或靠近其他热源，长时期靠近热源会使橡胶老化。
2. 带避孕套的最佳时间是阴茎勃起以后，和阴茎与阴部或肛门接触前。
3. 在使用避孕套将阴茎包皮翻起，这样可以增加灵活性和减少避孕套在性交中破裂的风险。
4. 在避孕套前留下一小段来存储精液，大多数避孕套前断会有一个用来存储精液的突出，在带避孕套时将它挤扁，不要让空气进入其中将其撑大。
5. 如果在使用或安置阴茎时阴茎中止勃起或者安置时带错了方向，请换用一个新的避孕套。
6. 使用天然橡胶制成的避孕套尽量避免使用凡士林或其他油性的涂剂，他们之间会起化学反应。
7. 在肛交时应该使用专门的避孕套，肛交避孕套特别加厚了材质，普通的避孕套很可能在肛交中破裂。
8. 不要使用过期的避孕套，过期避孕套很可能在性交中破裂。
9. 在射精完后，即使你仍然勃起，也请立即把阴茎从阴道或肛门中拔出以避免不必要的风险。
10.在拔出阴茎时，按住避孕套的根部，防止起脱落。
11.性交完，应先把手和阴茎洗干净再去接触其他人。
12.避孕套都是一次性的，不要反复使用。
13.挑选尺寸合适的避孕套。
14.没有经验的使用者应该在光线明亮的地方练习使用避孕套，以保证在性交前能正确安上。